15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4341 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5022  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105589  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5838  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4341  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  77.78 
 
 
50 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  72 
 
 
52 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5076  hypothetical protein  94.12 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3216  hypothetical protein  96.08 
 
 
51 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965485  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5276  hypothetical protein  84.31 
 
 
51 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  51.35 
 
 
50 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4156  hypothetical protein  59.38 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  70 
 
 
52 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  70 
 
 
52 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1841  hypothetical protein  68.63 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.644348  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2402  hypothetical protein  78.12 
 
 
51 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5990  hypothetical protein  62 
 
 
52 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>