14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2402 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2402  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  75 
 
 
50 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  66 
 
 
52 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  68.63 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  68.63 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4156  hypothetical protein  62.5 
 
 
51 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5022  hypothetical protein  78.79 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105589  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5076  hypothetical protein  78.79 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5838  hypothetical protein  78.79 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5276  hypothetical protein  75.76 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4341  hypothetical protein  78.79 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3216  hypothetical protein  78.79 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965485  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  54.05 
 
 
50 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7233  hypothetical protein  81.25 
 
 
51 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>