17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3331 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  72.22 
 
 
50 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  62.16 
 
 
50 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  61.54 
 
 
52 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  61.54 
 
 
52 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2051  hypothetical protein  81.82 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5990  hypothetical protein  73.08 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5076  hypothetical protein  74 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1841  hypothetical protein  76 
 
 
51 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.644348  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0060  hypothetical protein  65.38 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.517772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3236  hypothetical protein  79.41 
 
 
53 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1879  hypothetical protein  71.15 
 
 
52 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4156  hypothetical protein  52 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3216  hypothetical protein  81.82 
 
 
51 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965485  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4341  hypothetical protein  81.82 
 
 
51 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5838  hypothetical protein  81.82 
 
 
51 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5022  hypothetical protein  81.82 
 
 
51 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>