13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2051 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2051  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  65.38 
 
 
52 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  58.33 
 
 
50 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  69.23 
 
 
52 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  69.23 
 
 
52 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5990  hypothetical protein  71.15 
 
 
52 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  51.35 
 
 
50 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3236  hypothetical protein  76.47 
 
 
53 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1879  hypothetical protein  80.77 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5076  hypothetical protein  84.38 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0060  hypothetical protein  59.62 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.517772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1841  hypothetical protein  68 
 
 
51 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.644348  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0444  hypothetical protein  83.87 
 
 
51 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>