15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4701 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4701  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1179  hypothetical protein  58.49 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162889  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5099  hypothetical protein  60.38 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108629  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3250  hypothetical protein  60.38 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.285478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4993  hypothetical protein  60.38 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0615586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3167  hypothetical protein  60.38 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.2993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4312  hypothetical protein  60.38 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352665  hitchhiker  0.000000788175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5239  hypothetical protein  58.49 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2951  hypothetical protein  60.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4437  hypothetical protein  52.83 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0012  hypothetical protein  54.72 
 
 
61 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4312  hypothetical protein  54.72 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.906077  normal  0.829461 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4422  hypothetical protein  54.72 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671281  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0029  hypothetical protein  52.83 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0623  hypothetical protein  54.72 
 
 
61 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>