16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1179 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162889  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0029  hypothetical protein  55.88 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0012  hypothetical protein  58.18 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5099  hypothetical protein  56.36 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108629  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3250  hypothetical protein  56.36 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.285478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4437  hypothetical protein  52.94 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4312  hypothetical protein  54.55 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.906077  normal  0.829461 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4422  hypothetical protein  54.55 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4993  hypothetical protein  56.36 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0615586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3167  hypothetical protein  56.36 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4312  hypothetical protein  56.36 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352665  hitchhiker  0.000000788175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0623  hypothetical protein  56.36 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5239  hypothetical protein  54.55 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4701  hypothetical protein  58.49 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2951  hypothetical protein  56.36 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3545  hypothetical protein  35 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>