15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0012 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0012  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4437  hypothetical protein  86.44 
 
 
81 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0029  hypothetical protein  86.44 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5099  hypothetical protein  80 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108629  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3250  hypothetical protein  80 
 
 
67 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.285478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5239  hypothetical protein  80 
 
 
65 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4312  hypothetical protein  75.41 
 
 
106 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.906077  normal  0.829461 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4422  hypothetical protein  75.41 
 
 
106 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671281  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4993  hypothetical protein  78.33 
 
 
65 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0615586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3167  hypothetical protein  78.33 
 
 
65 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.2993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4312  hypothetical protein  78.33 
 
 
65 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352665  hitchhiker  0.000000788175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0623  hypothetical protein  79.66 
 
 
61 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2951  hypothetical protein  76.67 
 
 
65 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1179  hypothetical protein  58.18 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162889  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4701  hypothetical protein  54.72 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>