15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0029 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0029  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  140  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4437  hypothetical protein  93.94 
 
 
81 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0012  hypothetical protein  86.44 
 
 
61 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4993  hypothetical protein  75.38 
 
 
65 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0615586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3167  hypothetical protein  75.38 
 
 
65 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.2993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4312  hypothetical protein  75.38 
 
 
65 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352665  hitchhiker  0.000000788175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5239  hypothetical protein  75.38 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5099  hypothetical protein  75.81 
 
 
102 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108629  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3250  hypothetical protein  75.81 
 
 
67 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.285478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2951  hypothetical protein  75 
 
 
65 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0623  hypothetical protein  74.58 
 
 
61 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4312  hypothetical protein  69.49 
 
 
106 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.906077  normal  0.829461 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4422  hypothetical protein  69.49 
 
 
106 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671281  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1179  hypothetical protein  55.88 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162889  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4701  hypothetical protein  52.83 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>