16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4048 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4048  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  253  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726239  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  46.46 
 
 		 184 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  44.44 
 
 		 184 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  44.44 
 
 		 184 aa  87  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  43.43 
 
 		 184 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  43.02 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  31.07 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  32.69 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  30.1 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  32.71 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  34.65 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  32.04 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4017  protein of unknown function DUF820  26.72 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.389998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0099  protein of unknown function DUF820  32.58 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  30.69 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>