13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1897 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1897  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0219114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2980  hypothetical protein  78.82 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2637  hypothetical protein  31.89 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0215  hypothetical protein  27.75 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3065  hypothetical protein  30.68 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.882599  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4325  hypothetical protein  29.53 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0638365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2877  hypothetical protein  26.23 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4147  hypothetical protein  31.25 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3051  hypothetical protein  27.72 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00459419  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1453  hypothetical protein  30.3 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0417738  hitchhiker  0.00575675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2903  hypothetical protein  25 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0584  hypothetical protein  28.87 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.349057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2109  hypothetical protein  28.21 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>