9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4147 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4147  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0584  hypothetical protein  77.13 
 
 		 188 aa  310  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.349057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4325  hypothetical protein  37.97 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0638365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0215  hypothetical protein  38.1 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2109  hypothetical protein  31.67 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1897  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0219114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3065  hypothetical protein  32.28 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.882599  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2980  hypothetical protein  29.61 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2637  hypothetical protein  30.77 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>