More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3166 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3166  adenylylsulfate kinase  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24694  adenylylsulfate kinase  53.85 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5557  adenylylsulfate kinase  53.89 
 
 		 222 aa  185  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1500  adenylylsulfate kinase  51.48 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2622  adenylylsulfate kinase  51.5 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0591419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  52.1 
 
 		 638 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3519  adenylate sulfate kinase protein  48.54 
 
 		 209 aa  177  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00500  Adenylylsulfate kinase, C-terminal domain protein  58.94 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3345  Adenylyl-sulfate kinase  51.9 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0800  adenylyl-sulfate kinase  49.7 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000729878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0962  adenylylsulfate kinase  51.76 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3723  adenylylsulfate kinase  51.76 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0864  adenylylsulfate kinase  52.8 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2482  adenylylsulfate kinase  51.81 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.288285  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27091  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 227 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02401  adenylylsulfate kinase  49.7 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1689  adenylyl-sulfate kinase  46.71 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0334  adenylyl-sulfate kinase  47.56 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  50.59 
 
 		 638 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0423  adenylylsulfate kinase  48.5 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1533  adenylylsulfate kinase  49.09 
 
 		 212 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  50.9 
 
 		 640 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1363  adenylyl-sulfate kinase  49.7 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  51.5 
 
 		 614 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  49.09 
 
 		 647 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4032  adenylylsulfate kinase  51.22 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4775  Adenylyl-sulfate kinase  53.37 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5895  adenylyl-sulfate kinase  52.41 
 
 		 201 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851674  normal  0.0986241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  48.78 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2100  adenylylsulfate kinase  50.6 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4837  adenylylsulfate kinase  51.22 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0585023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2350  adenylyl-sulfate kinase  50.9 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0248  adenylyl-sulfate kinase  54.27 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0820  adenylyl-sulfate kinase  49.69 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0866  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0666  adenylylsulfate kinase  47.57 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0903  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2985  adenylyl-sulfate kinase  45.41 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.879711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  54.19 
 
 		 604 aa  168  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4087  adenylylsulfate kinase  45.11 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0834  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  49.07 
 
 		 640 aa  168  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2576  adenylylsulfate kinase  51.19 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2888  adenylylsulfate kinase  51.79 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  46.34 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2332  adenylyl-sulfate kinase  50.9 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0456568  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16180  Adenylylsulfate kinase  56.95 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.732852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0833  adenylylsulfate kinase  49.7 
 
 		 204 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.21 
 
 		 651 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1565  sulfate adenylyltransferase, large subunit  53.29 
 
 		 637 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2957  adenylyl-sulfate kinase  46.24 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1425  adenylyl-sulfate kinase  47.59 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.403059  normal  0.0845056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3069  adenylylsulfate kinase  49.41 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01861  adenylylsulfate kinase  45.12 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3191  adenylyl-sulfate kinase  52.44 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.942826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0166  adenylylsulfate kinase  52.15 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0957  adenylylsulfate kinase  48.54 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0931  adenylylsulfate kinase  48.54 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3405  adenylylsulfate kinase  48.54 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3123  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3058  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3139  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.476768  normal  0.15294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3184  adenylylsulfate kinase  47.65 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3243  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3084  adenylylsulfate kinase  50 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0450  adenylylsulfate kinase  53.85 
 
 		 260 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0168  adenylylsulfate kinase  44.85 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3593  sulfate adenylyltransferase, large subunit  58.11 
 
 		 617 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.876759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2135  adenylylsulfate kinase  48.81 
 
 		 215 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3040  adenylylsulfate kinase  48.54 
 
 		 205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001704  adenylylsulfate kinase  47.34 
 
 		 205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3221  adenylylsulfate kinase  49.09 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3831  adenylyl-sulfate kinase  48.5 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4334  adenylylsulfate kinase  52.1 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22650  Adenylyl-sulfate kinase  49.09 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0712  adenylyl-sulfate kinase  44.24 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000090997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0962  adenylylsulfate kinase  48.48 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.510912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1882  adenylyl-sulfate kinase  50.88 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0221564 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01841  adenylylsulfate kinase  44.24 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0299  adenylylsulfate kinase  49.4 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01831  adenylylsulfate kinase  45.83 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.573546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  47.1 
 
 		 644 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1068  sulfate adenylyltransferase, large subunit  46.43 
 
 		 652 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0965  adenylylsulfate kinase  47.95 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2888  adenylylsulfate kinase  48.48 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02600  adenylylsulfate kinase  48.48 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0938  Adenylyl-sulfate kinase  48.48 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2375  adenylylsulfate kinase  52.07 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0637  adenylylsulfate kinase  52.07 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4002  adenylylsulfate kinase  48.48 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1690  adenylylsulfate kinase  52.07 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.228231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2799  adenylylsulfate kinase  52.07 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3051  adenylylsulfate kinase  48.48 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.256539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2912  adenylylsulfate kinase  52.07 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2676  adenylylsulfate kinase  52.07 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3124  adenylylsulfate kinase  48.48 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2876  adenylylsulfate kinase  48.48 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.878793 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2733  adenylylsulfate kinase  52.07 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.57754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02565  hypothetical protein  48.48 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6392  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  51.33 
 
 		 640 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>