25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1656 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1656  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1063    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1015  gp41  58.26 
 
 		 223 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1661  hypothetical protein  58.26 
 
 		 221 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2829  hypothetical protein  34.62 
 
 		 104 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6797  hypothetical protein  43.02 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1960  GP46  40.59 
 
 		 115 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  0.0379275 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  53.9  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4440  hypothetical protein  34.74 
 
 		 262 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1855  hypothetical protein  43.94 
 
 		 435 aa  53.5  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000602593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2002  GP46  38.61 
 
 		 115 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00138731  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1953  GP46  38.61 
 
 		 115 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000678855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2575  GP46  43.68 
 
 		 110 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.029841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3507  GP46  43.68 
 
 		 106 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0774755  hitchhiker  0.00450512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3428  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000500038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3275  GP46  29.13 
 
 		 107 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000845593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3271  GP46  42.53 
 
 		 106 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0728  GP46  42.53 
 
 		 106 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00505701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3408  GP46  42.53 
 
 		 106 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559716  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3382  GP46  42.53 
 
 		 106 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000163706  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0089  hypothetical protein  30.93 
 
 		 214 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0758  GP46  42.53 
 
 		 106 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00217936  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1845  GP46  42.53 
 
 		 106 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00167765  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0339  hypothetical protein  47.06 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1563  hypothetical protein  51.11 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5227  hypothetical protein  51.11 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>