21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0758 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0758  GP46  100 
 
 
106 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00217936  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2002  GP46  94.34 
 
 
115 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00138731  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3507  GP46  93.4 
 
 
106 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0774755  hitchhiker  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1960  GP46  92.45 
 
 
115 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  0.0379275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3382  GP46  92.45 
 
 
106 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000163706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1845  GP46  91.51 
 
 
106 aa  202  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00167765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0728  GP46  90.57 
 
 
106 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00505701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3271  GP46  91.51 
 
 
106 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2575  GP46  89.62 
 
 
110 aa  200  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.029841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1953  GP46  89.62 
 
 
115 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000678855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3408  GP46  89.62 
 
 
106 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559716  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3275  GP46  45.79 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000845593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0751  hypothetical protein  88.89 
 
 
45 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.852323  hitchhiker  0.0026184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4440  hypothetical protein  38.24 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4295  hypothetical protein  36.73 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1656  hypothetical protein  42.53 
 
 
521 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1015  gp41  39.08 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1661  hypothetical protein  40.23 
 
 
221 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2204  hypothetical protein  34.95 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000075026  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2829  hypothetical protein  37.21 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2804  hypothetical protein  33.01 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.27938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>