8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3655 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3655  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1360  hypothetical protein  43.81 
 
 		 195 aa  150  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0019  hypothetical protein  45.65 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0022  hypothetical protein  46.84 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.842797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1980  hypothetical protein  42.39 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3652  hypothetical protein  30.05 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4750  hypothetical protein  28.24 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1864  hypothetical protein  28 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>