10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1360 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1360  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0019  hypothetical protein  80.98 
 
 		 203 aa  299  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0022  hypothetical protein  60.54 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.842797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1980  hypothetical protein  55.91 
 
 		 219 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3655  hypothetical protein  43.81 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3652  hypothetical protein  41.71 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1864  hypothetical protein  31.64 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4750  hypothetical protein  29.17 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7167  hypothetical protein  34.02 
 
 		 226 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6326  hypothetical protein  35.59 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>