10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0019 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1360  hypothetical protein  80.98 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0022  hypothetical protein  58.38 
 
 		 196 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.842797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1980  hypothetical protein  55.14 
 
 		 219 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3655  hypothetical protein  45.65 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3652  hypothetical protein  40.11 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1864  hypothetical protein  31.07 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7167  hypothetical protein  31.25 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4750  hypothetical protein  28.22 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6326  hypothetical protein  32.77 
 
 		 223 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>