12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0017 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0017  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3653  hypothetical protein  55.31 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1358  hypothetical protein  53.71 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1357  hypothetical protein  47.43 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.783887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1982  hypothetical protein  47.73 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1863  hypothetical protein  40.61 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0186  hypothetical protein  41.84 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4170  hypothetical protein  36.17 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000403496  normal  0.117669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1117  hypothetical protein  33.78 
 
 		 80 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1620  hypothetical protein  34.04 
 
 		 128 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0813  hypothetical protein  30.15 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0021  hypothetical protein  34.02 
 
 		 241 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>