11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4170 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4170  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000403496  normal  0.117669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0813  hypothetical protein  42.4 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0021  hypothetical protein  45.97 
 
 		 241 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1620  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1357  hypothetical protein  39.78 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.783887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1982  hypothetical protein  33.86 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3653  hypothetical protein  33.6 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1358  hypothetical protein  39.78 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0017  hypothetical protein  36.17 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0186  hypothetical protein  34.74 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>