12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3653 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3653  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0017  hypothetical protein  55.31 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1358  hypothetical protein  47.78 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1982  hypothetical protein  53.11 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1357  hypothetical protein  45.76 
 
 		 176 aa  147  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.783887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1863  hypothetical protein  39.41 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4170  hypothetical protein  33.6 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000403496  normal  0.117669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0813  hypothetical protein  33.07 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0186  hypothetical protein  32.28 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0021  hypothetical protein  32.06 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1117  hypothetical protein  33.8 
 
 		 80 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3053  hypothetical protein  28.97 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>