7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_R0012 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_R0012  Cobalamin riboswitch  100 
 
 		 198 bp  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414583  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0051    83.83 
 
 		 199 bp  93.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0245414  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0063    93.18 
 
 		 206 bp  58  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0011  Cobalamin riboswitch  84.27 
 
 		 203 bp  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.364566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0072  Cobalamin riboswitch  91.43 
 
 		 214 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.944702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0049    100 
 
 		 208 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0050    100 
 
 		 209 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193277  normal  0.586253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>