12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4367 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4367  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2569  hypothetical protein  49.18 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5096  hypothetical protein  42.03 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3329  hypothetical protein  34.85 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39090  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4341  hypothetical protein  43.14 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3429  hypothetical protein  44.64 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0979  hypothetical protein  39.47 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0554868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4647  hypothetical protein  37.74 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4406  hypothetical protein  28.36 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.228919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1448  hypothetical protein  27.59 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2621  hypothetical protein  32.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>