13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39090  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3329  hypothetical protein  84.34 
 
 		 165 aa  273  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4341  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3967  hypothetical protein  34.78 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1448  hypothetical protein  42.71 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4406  hypothetical protein  42.71 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.228919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2569  hypothetical protein  41.46 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4367  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3429  hypothetical protein  44.44 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5096  hypothetical protein  35.94 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0979  hypothetical protein  34.78 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0554868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2621  hypothetical protein  37.04 
 
 		 118 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>