14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3329 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3329  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39090  hypothetical protein  84.34 
 
 		 166 aa  273  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4341  hypothetical protein  37.23 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2569  hypothetical protein  43.02 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3967  hypothetical protein  31.65 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1448  hypothetical protein  36.89 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4406  hypothetical protein  36.89 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.228919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4367  hypothetical protein  31.25 
 
 		 107 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3429  hypothetical protein  46.15 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5096  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0979  hypothetical protein  35.29 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0554868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2621  hypothetical protein  37.31 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0191  putative GTP cyclohydrolase  31.58 
 
 		 304 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4647  hypothetical protein  35.09 
 
 		 110 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>