8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1448 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1448  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  354  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4406  hypothetical protein  92 
 
 		 175 aa  330  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.228919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3967  hypothetical protein  53.69 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39090  hypothetical protein  42.71 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4341  hypothetical protein  34.91 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3329  hypothetical protein  36.89 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2569  hypothetical protein  28.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4367  hypothetical protein  27.59 
 
 		 107 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.0176423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>