20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4289 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0614  hypothetical protein  64.92 
 
 		 207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  34.22 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  34.05 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  33.16 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  32.09 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  31.89 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  30.1 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  27.23 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  25.51 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  30.68 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  28.5 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  26.74 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  27.59 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  29.08 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  28.34 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>