26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3496 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3496  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  838    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0646  hypothetical protein  79.8 
 
 		 413 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4400  hypothetical protein  71.57 
 
 		 425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5426  protein of unknown function DUF763  69.76 
 
 		 414 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167115  hitchhiker  0.0091498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2730  hypothetical protein  70.53 
 
 		 443 aa  589  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.252799  normal  0.0414028 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5130  protein of unknown function DUF763  69.51 
 
 		 414 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.738653  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1733  protein of unknown function DUF763  67.87 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2571  hypothetical protein  66.33 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223682  normal  0.445631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3205  hypothetical protein  49.76 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2835  hypothetical protein  52.39 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.011435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4063  protein of unknown function DUF763  51.75 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000157406  normal  0.0638485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1990  protein of unknown function DUF763  42.71 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000614194  normal  0.138146 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0136  hypothetical protein  44.78 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000501513  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0772  protein of unknown function DUF763  41.05 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.446587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1047  protein of unknown function DUF763  44.54 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.93099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1361  hypothetical protein  44.69 
 
 		 388 aa  302  9e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1144  hypothetical protein  45.11 
 
 		 371 aa  296  6e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0022  hypothetical protein  42.09 
 
 		 370 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.982389  normal  0.0622424 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1062  hypothetical protein  40.78 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0026  hypothetical protein  39.09 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0713  protein of unknown function DUF763  35.66 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045514  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2156  hypothetical protein  39.09 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1191  hypothetical protein  39.17 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0261  protein of unknown function DUF763  35.68 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0265  hypothetical protein  35.08 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.499335  decreased coverage  0.0000000041207 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1523  hypothetical protein  33.24 
 
 		 380 aa  219  7.999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.427834  normal  0.251629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>