26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2835 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2835  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  845    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.011435  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4063  protein of unknown function DUF763  71.93 
 
 
400 aa  614  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000157406  normal  0.0638485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3205  hypothetical protein  62.59 
 
 
406 aa  538  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5426  protein of unknown function DUF763  50.84 
 
 
414 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167115  hitchhiker  0.0091498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3496  hypothetical protein  52.39 
 
 
415 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579096  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5130  protein of unknown function DUF763  50.84 
 
 
414 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.738653  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4400  hypothetical protein  50.24 
 
 
425 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0646  hypothetical protein  52.63 
 
 
413 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2730  hypothetical protein  49.76 
 
 
443 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.252799  normal  0.0414028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1733  protein of unknown function DUF763  50.24 
 
 
433 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2571  hypothetical protein  50.89 
 
 
446 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223682  normal  0.445631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0136  hypothetical protein  46.96 
 
 
362 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000501513  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1990  protein of unknown function DUF763  43.49 
 
 
387 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000614194  normal  0.138146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1047  protein of unknown function DUF763  45.2 
 
 
364 aa  332  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.93099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0772  protein of unknown function DUF763  43.39 
 
 
358 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.446587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1144  hypothetical protein  44.54 
 
 
371 aa  317  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1361  hypothetical protein  43.63 
 
 
388 aa  292  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0713  protein of unknown function DUF763  40.11 
 
 
361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045514  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1062  hypothetical protein  41.18 
 
 
373 aa  260  3e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1191  hypothetical protein  42.05 
 
 
385 aa  256  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0022  hypothetical protein  39.59 
 
 
370 aa  249  4e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.982389  normal  0.0622424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0261  protein of unknown function DUF763  38.96 
 
 
379 aa  249  6e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1523  hypothetical protein  38.13 
 
 
380 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.427834  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0265  hypothetical protein  37.43 
 
 
389 aa  241  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.499335  decreased coverage  0.0000000041207 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0026  hypothetical protein  37.83 
 
 
371 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2156  hypothetical protein  39.62 
 
 
369 aa  240  4e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>