26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1523 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1523  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  773    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.427834  normal  0.251629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0261  protein of unknown function DUF763  59.06 
 
 
379 aa  485  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0026  hypothetical protein  42.9 
 
 
371 aa  296  4e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2156  hypothetical protein  41.99 
 
 
369 aa  293  5e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1062  hypothetical protein  41.99 
 
 
373 aa  291  1e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0265  hypothetical protein  43.98 
 
 
389 aa  289  6e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.499335  decreased coverage  0.0000000041207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0022  hypothetical protein  41.39 
 
 
370 aa  288  8e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.982389  normal  0.0622424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1191  hypothetical protein  40.17 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0713  protein of unknown function DUF763  40 
 
 
361 aa  270  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3205  hypothetical protein  40.16 
 
 
406 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4063  protein of unknown function DUF763  38.38 
 
 
400 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000157406  normal  0.0638485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1047  protein of unknown function DUF763  39.1 
 
 
364 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.93099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2835  hypothetical protein  38.13 
 
 
408 aa  246  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.011435  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1144  hypothetical protein  38.79 
 
 
371 aa  246  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0136  hypothetical protein  35.58 
 
 
362 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000501513  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0772  protein of unknown function DUF763  36.83 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.446587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2571  hypothetical protein  36.8 
 
 
446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223682  normal  0.445631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1990  protein of unknown function DUF763  35.75 
 
 
387 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000614194  normal  0.138146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1361  hypothetical protein  36.8 
 
 
388 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0646  hypothetical protein  35.03 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2730  hypothetical protein  34.55 
 
 
443 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.252799  normal  0.0414028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3496  hypothetical protein  33.24 
 
 
415 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579096  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5426  protein of unknown function DUF763  33.76 
 
 
414 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167115  hitchhiker  0.0091498 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5130  protein of unknown function DUF763  33.69 
 
 
414 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.738653  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1733  protein of unknown function DUF763  34.2 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4400  hypothetical protein  32.1 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.333483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>