21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4082 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4082  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1070    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.449833  normal  0.903011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4084  hypothetical protein  83.79 
 
 
512 aa  880    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5054  hypothetical protein  76.37 
 
 
554 aa  796    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2742  hypothetical protein  70.99 
 
 
562 aa  771    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329998  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2740  hypothetical protein  69.44 
 
 
519 aa  759    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340229  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02461  hypothetical protein  43.2 
 
 
560 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03642  hypothetical protein  42.75 
 
 
560 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03638  hypothetical protein  42.94 
 
 
558 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02458  hypothetical protein  41.99 
 
 
546 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0102  hypothetical protein  41.02 
 
 
552 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3227  hypothetical protein  44.57 
 
 
512 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1585  hypothetical protein  43.88 
 
 
511 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0129  hypothetical protein  44.24 
 
 
462 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1694  hypothetical protein  40.62 
 
 
552 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0204  hypothetical protein  41.35 
 
 
512 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0274646  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1613  hypothetical protein  44.37 
 
 
552 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0097  hypothetical protein  43.42 
 
 
511 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0091  hypothetical protein  43.68 
 
 
512 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.812595  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4518  hypothetical protein  32.17 
 
 
494 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03190  hypothetical protein  24.02 
 
 
480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00107546  hitchhiker  0.000000000148486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1251  hypothetical protein  24.64 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>