13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0778 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0778  type III effector HopAG1  100 
 
 		 716 aa  1476    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0901  type III effector HopAG1  75.68 
 
 		 152 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0423  hypothetical protein  38.4 
 
 		 242 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.526011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4767  type III effector HopAG1  35.68 
 
 		 275 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3201  hypothetical protein  34.36 
 
 		 240 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40 
 
 		 170 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 156 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 302 aa  45.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 147 aa  44.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 144 aa  44.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 153 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  27.05 
 
 		 141 aa  44.3  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 143 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>