15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1123 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1123  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  286  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0331  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1601  hypothetical protein  40.77 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.18747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2899  hypothetical protein  39.68 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.304813  normal  0.409222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0518  hypothetical protein  38.81 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1700  hypothetical protein  34.13 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2948  hypothetical protein  32.5 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.181579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0560  hypothetical protein  34.4 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0585  hypothetical protein  34.4 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0591  hypothetical protein  34.4 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4606  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.84506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3231  hypothetical protein  26.87 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4014  hypothetical protein  29 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3890  hypothetical protein  41.18 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2178  hypothetical protein  34 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.925437  normal  0.93497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>