17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0518 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0518  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  313  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1123  hypothetical protein  38.81 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0331  hypothetical protein  37.04 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1700  hypothetical protein  35.11 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2899  hypothetical protein  35.38 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.304813  normal  0.409222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0585  hypothetical protein  34.17 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0591  hypothetical protein  34.17 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0560  hypothetical protein  34.17 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2948  hypothetical protein  31.2 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.181579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1601  hypothetical protein  31.06 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.18747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3890  hypothetical protein  54.72 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4014  hypothetical protein  27.82 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2178  hypothetical protein  38.95 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.925437  normal  0.93497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4606  hypothetical protein  26.77 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.84506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0085  hypothetical protein  36.11 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3231  hypothetical protein  29.5 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2307  hypothetical protein  30.6 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.180417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>