13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4988 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4988  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4939  hypothetical protein  96.11 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4811  hypothetical protein  96.5 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0529  hypothetical protein  91.05 
 
 		 257 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0533  hypothetical protein  59.04 
 
 		 257 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4987  hypothetical protein  59.43 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613589  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0065  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0205  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.391854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0073  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.131327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0110  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1177  hypothetical protein  28.17 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3107  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>