22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4801 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4801  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.472026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03370  hypothetical protein  42.32 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  6.16772e-22 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003217  hypothetical protein  41.53 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0936  hypothetical protein  37.08 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.792793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03360  hypothetical protein  35.94 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000516345  unclonable  5.57606e-22 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0937  hypothetical protein  31.4 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3585  protein of unknown function UPF0174  26.67 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0011  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0010  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.642715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0011  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0012  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.242726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0012  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00011  hypothetical protein  26.67 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00011  hypothetical protein  26.67 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3644  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0010  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0202252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0010  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0010  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0010  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.503351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0010  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0398298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3728  hypothetical protein  22.77 
 
 		 475 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1808  hypothetical protein  22.98 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>