22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1909 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3261  hypothetical protein  47.91 
 
 
1001 aa  891    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.20626  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1909  hypothetical protein  100 
 
 
952 aa  1962    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4358  hypothetical protein  23.32 
 
 
1002 aa  86.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3752  hypothetical protein  24.84 
 
 
1127 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1707  hypothetical protein  23.91 
 
 
1090 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1848  hypothetical protein  22.44 
 
 
1085 aa  61.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47429  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2237  hypothetical protein  22.88 
 
 
1120 aa  55.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.34199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1630  hypothetical protein  22.37 
 
 
1120 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3265  hypothetical protein  22.37 
 
 
1120 aa  55.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3687  hypothetical protein  22.37 
 
 
1120 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3285  hypothetical protein  22.04 
 
 
1120 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3594  hypothetical protein  22.04 
 
 
1123 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3603  hypothetical protein  22.04 
 
 
1120 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3372  hypothetical protein  22.04 
 
 
1120 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4288  hypothetical protein  23.26 
 
 
1097 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400054  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3637  hypothetical protein  22.04 
 
 
1156 aa  53.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3586  hypothetical protein  22.18 
 
 
1120 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3335  hypothetical protein  22.18 
 
 
1120 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5168  hypothetical protein  25.39 
 
 
1097 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1243  hypothetical protein  29.95 
 
 
906 aa  49.3  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1316  hypothetical protein  27.81 
 
 
763 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208096  unclonable  0.0000000343046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4732  hypothetical protein  22.73 
 
 
910 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0060495  normal  0.428357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>