25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3261 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1909  hypothetical protein  47.91 
 
 
952 aa  891    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3261  hypothetical protein  100 
 
 
1001 aa  2050    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.20626  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3752  hypothetical protein  25.42 
 
 
1127 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4358  hypothetical protein  24.08 
 
 
1002 aa  79.7  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1243  hypothetical protein  27.43 
 
 
906 aa  73.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1316  hypothetical protein  27.63 
 
 
763 aa  68.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208096  unclonable  0.0000000343046 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3356  hypothetical protein  26.9 
 
 
920 aa  65.1  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1848  hypothetical protein  22.24 
 
 
1085 aa  64.7  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47429  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4732  hypothetical protein  26.57 
 
 
910 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0060495  normal  0.428357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1707  hypothetical protein  24.66 
 
 
1090 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5168  hypothetical protein  24.31 
 
 
1097 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3265  hypothetical protein  22.53 
 
 
1120 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3335  hypothetical protein  22.53 
 
 
1120 aa  52.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3285  hypothetical protein  22.22 
 
 
1120 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3586  hypothetical protein  22.84 
 
 
1120 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3594  hypothetical protein  22.53 
 
 
1123 aa  52  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3603  hypothetical protein  22.53 
 
 
1120 aa  52  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1630  hypothetical protein  22.77 
 
 
1120 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3687  hypothetical protein  22.77 
 
 
1120 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3372  hypothetical protein  22.53 
 
 
1120 aa  51.2  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0919  hypothetical protein  22.1 
 
 
1131 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3637  hypothetical protein  23.77 
 
 
1156 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2237  hypothetical protein  21.98 
 
 
1120 aa  49.3  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.34199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0946  hypothetical protein  21.82 
 
 
1131 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4288  hypothetical protein  24.24 
 
 
1097 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>