13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1566 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1566  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  276  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0359  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.170559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0612  hypothetical protein  31.97 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1845  putative transmembrane protein  42.11 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298239  hitchhiker  0.000000196844 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5382  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2658  hypothetical protein  27.82 
 
 		 170 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3434  putative transmembrane protein  33.59 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2628  hypothetical protein  29.37 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0242868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1885  putative transmembrane protein  28.24 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00765988  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0707  transmembrane protein  29.91 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.192149  normal  0.111144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1556  hypothetical protein  28.24 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969834  normal  0.226901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0358  hypothetical protein  45.24 
 
 		 48 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.205761 
 
 
-
 
NC_003296  RS01728  hypothetical protein  27.07 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.906647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>