More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0159 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0159  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
316 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.852546  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0173  S-adenosyl-methyltransferase MraW  86.94 
 
 
316 aa  559  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.75 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2987  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.25 
 
 
332 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.86 
 
 
317 aa  341  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.86 
 
 
317 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0069  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.1 
 
 
313 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.1 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.1 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.78 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.64263  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2559  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3553  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3533  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1339  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3224  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.78 
 
 
313 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3558  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 
313 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.78 
 
 
313 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302053  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.78 
 
 
313 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.46 
 
 
313 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2732  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.5 
 
 
319 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3097  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 
319 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3425  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.33 
 
 
306 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.19 
 
 
317 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.94 
 
 
319 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.59 
 
 
321 aa  322  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1067  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.52 
 
 
305 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250265  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0911  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.52 
 
 
307 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3433  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.02 
 
 
309 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.02 
 
 
308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2988  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.35 
 
 
308 aa  305  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.68 
 
 
311 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.35 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990517  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1462  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.37 
 
 
309 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.43 
 
 
313 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.27 
 
 
334 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.06 
 
 
313 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.06 
 
 
313 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.06 
 
 
313 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.48 
 
 
318 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.06 
 
 
313 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.06 
 
 
313 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.53 
 
 
320 aa  291  8e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.53 
 
 
320 aa  291  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.53 
 
 
320 aa  291  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.17 
 
 
313 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.69 
 
 
313 aa  288  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.17 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0813  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.33 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730064  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.96 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4473  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.9 
 
 
316 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.3 
 
 
313 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.98 
 
 
313 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0514  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.55 
 
 
325 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.175948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.96 
 
 
314 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.26 
 
 
347 aa  279  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.15 
 
 
313 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.15 
 
 
313 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.96 
 
 
307 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.32 
 
 
313 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.06 
 
 
313 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.48 
 
 
319 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.69 
 
 
314 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.65 
 
 
307 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.9 
 
 
312 aa  275  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  275  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.63 
 
 
313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.21 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.45 
 
 
312 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  47.78 
 
 
311 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.69 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2201  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.37 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379608  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.38 
 
 
315 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.38 
 
 
315 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0524  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.48 
 
 
317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.3 
 
 
316 aa  268  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.12 
 
 
340 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.06 
 
 
313 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.2 
 
 
311 aa  267  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
313 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1987  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.79 
 
 
316 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>