29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4811 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4811  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0622579  hitchhiker  0.00296923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  61.02 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  61.29 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  59.68 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  50 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  50.82 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  50.82 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0856  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.623315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0171  addiction module antidote protein  43.1 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0829  hypothetical protein  40.98 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00761962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3174  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15560  hypothetical protein  48.08 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000160918  unclonable  2.1203199999999998e-22 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2537  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.35922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0569  Cro/CI family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3780  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.798445  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3743  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0420  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.461361  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0898  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368951  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5507  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4583  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205891  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3672  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.932392  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2314  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1542  Cro/CI family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1686  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2877  addiction module antidote protein  44.83 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1222  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 98 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>