33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4605 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4605  nucleotide binding protein, PINc  100 
 
 		 821 aa  1658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1882  Nucleotide binding protein PINc  31.34 
 
 		 815 aa  70.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000064311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  34.9 
 
 		 440 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  34.9 
 
 		 440 aa  56.2  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  29.17 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0148  PhoH family protein  28.87 
 
 		 428 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000131616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0099  PhoH family protein  29.94 
 
 		 512 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2239  PhoH family protein  31.03 
 
 		 441 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.198011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2521  nucleotide binding protein, PINc  28.65 
 
 		 442 aa  52  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.530709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2374  PhoH family protein  29.66 
 
 		 440 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.833123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2286  PhoH family protein  29.66 
 
 		 440 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1577  PhoH-like protein  29.66 
 
 		 440 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0911953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12201  hypothetical protein  32.03 
 
 		 463 aa  51.2  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  30.32 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  27.71 
 
 		 439 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2494  PhoH family protein  29.05 
 
 		 438 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415647  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1494  nucleotide binding protein, PINc  29.41 
 
 		 463 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1543  nucleotide binding protein, PINc  28.57 
 
 		 462 aa  48.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107982  normal  0.828891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1851  PhoH family ATPase  30.28 
 
 		 438 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1040  PhoH family protein  28.72 
 
 		 525 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.714092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2315  PhoH family protein  31.03 
 
 		 439 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.296996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  29.3 
 
 		 469 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  29.3 
 
 		 469 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47138  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.440722  normal  0.19959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  28.17 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2961  PhoH family protein  29.75 
 
 		 442 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  29.45 
 
 		 442 aa  45.8  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3373  PhoH family protein  32.45 
 
 		 446 aa  45.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  30.46 
 
 		 472 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1351  PhoH family protein  28 
 
 		 451 aa  45.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00120306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0831  PhoH family protein  28.4 
 
 		 412 aa  45.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  29.19 
 
 		 465 aa  44.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  29.14 
 
 		 466 aa  44.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>