17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3105 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  275  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3810  hypothetical protein  63.08 
 
 		 133 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500224  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1960  hypothetical protein  63.08 
 
 		 133 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228739  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27070  hypothetical protein  68.5 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.700813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10780  hypothetical protein  67.69 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2217  hypothetical protein  62.31 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2082  hypothetical protein  60.77 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0983  hypothetical protein  68.8 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2098  hypothetical protein  59.12 
 
 		 138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387663  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1851  hypothetical protein  59.85 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1705  hypothetical protein  60 
 
 		 135 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.934345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1998  hypothetical protein  60 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0532492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2107  hypothetical protein  63.25 
 
 		 133 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1190  hypothetical protein  56.39 
 
 		 151 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.311704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3158  hypothetical protein  59.06 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00000000241289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2445  hypothetical protein  54.2 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4020  hypothetical protein  56.49 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>