17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_10780  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  253  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0983  hypothetical protein  92.42 
 
 
132 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27070  hypothetical protein  74.22 
 
 
129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.700813  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1960  hypothetical protein  67.67 
 
 
133 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228739  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3810  hypothetical protein  66.17 
 
 
133 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500224  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3105  hypothetical protein  67.69 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2082  hypothetical protein  66.92 
 
 
133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2217  hypothetical protein  63.64 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2098  hypothetical protein  65.15 
 
 
138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387663  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2445  hypothetical protein  61.65 
 
 
145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1998  hypothetical protein  62.6 
 
 
134 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0532492  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1851  hypothetical protein  59.4 
 
 
158 aa  151  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1705  hypothetical protein  59.85 
 
 
135 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.934345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2107  hypothetical protein  65 
 
 
133 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3158  hypothetical protein  59.2 
 
 
148 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00000000241289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1190  hypothetical protein  54.62 
 
 
151 aa  137  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.311704  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4020  hypothetical protein  59.2 
 
 
131 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.924607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>