14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3023 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3023  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
499 aa  1018    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.197808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3025  heat shock protein DnaJ domain protein  40.04 
 
 
479 aa  326  7e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7073  heat shock protein DnaJ domain protein  38.6 
 
 
569 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0191  DnaJ domain-containing protein  40.68 
 
 
568 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  35.44 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4770  heat shock protein DnaJ-like  35.09 
 
 
570 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  37.7 
 
 
294 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3998  heat shock protein DnaJ, N-terminal  31.43 
 
 
515 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4295  DnaJ domain protein  38.6 
 
 
546 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  36.51 
 
 
375 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  36.51 
 
 
375 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 
382 aa  43.5  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2518  heat shock protein DnaJ-like  24.14 
 
 
548 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142302  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  35 
 
 
288 aa  43.1  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>