12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2324 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2324  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1263    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.601755  hitchhiker  0.00265307 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5346  hypothetical protein  30.87 
 
 		 590 aa  302  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.696692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3364  hypothetical protein  29.04 
 
 		 594 aa  224  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0052  hypothetical protein  27.54 
 
 		 481 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0913  hypothetical protein  28.44 
 
 		 407 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0720256 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0456  conserved hypothetical protein, putative transposase  22.49 
 
 		 489 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0084  hypothetical protein  21.36 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332452  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05117  hypothetical protein  21.39 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001248  hypothetical protein  20.81 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27761  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1540  hypothetical protein  20.66 
 
 		 774 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558465  normal  0.0476424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0828  hypothetical protein  21.32 
 
 		 821 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0920  hypothetical protein  21.32 
 
 		 821 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.522662  normal  0.48917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>