50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2038 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.400224  hitchhiker  0.00548732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3456  acetyltransferase  26.71 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.436369  hitchhiker  6.246790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1890  acetyltransferase  26.09 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  43.08 
 
 
168 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  35.19 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4326  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
151 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  41.27 
 
 
155 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  42.11 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
157 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.369915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  47.06 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0742663  normal  0.331805 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  40.58 
 
 
597 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  45.16 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  21.18 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1027  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.406805  normal  0.416971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1952  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0867  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.36 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3790  GCN5-related N-acetyltransferase  46.94 
 
 
150 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.195519  normal  0.0197578 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7217  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
169 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370692  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11650  sortase-like acyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.359043  normal  0.185087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.66 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1775  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
593 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10595  predicted protein  32.86 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.138069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.37 
 
 
153 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
160 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2307  acetyltransferase  36.84 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0323489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
381 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
164 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2346  acetyltransferase  38.18 
 
 
282 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000550372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
195 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1452  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
166 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2622  acetyltransferase, GNAT family  36.84 
 
 
282 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000149947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5642  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
153 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2569  acetyltransferase  36.84 
 
 
282 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
159 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1625  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
344 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
148 aa  41.2  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0152  hypothetical protein  29.27 
 
 
166 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
177 aa  41.2  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>