17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0256 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0256  carbonic anhydrase  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00337984  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0366  carbonic anhydrase  90.11 
 
 
182 aa  333  9e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.17181 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0547  carbonic anhydrase  41.3 
 
 
224 aa  95.1  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0390  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  30.46 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  36.36 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  35.21 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0442  carbonic anhydrase  32.79 
 
 
236 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  31.18 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  38.67 
 
 
234 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  30.77 
 
 
242 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  37.5 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  35.62 
 
 
217 aa  41.2  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  32.03 
 
 
220 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  33.73 
 
 
230 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  31.51 
 
 
246 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  30.77 
 
 
221 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>