11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2853 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2853  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1806  hypothetical protein  52 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4175  hypothetical protein  37.44 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0746034  normal  0.650092 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5554  hypothetical protein  37.93 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.689652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0181  hypothetical protein  34.86 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0889313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2518  hypothetical protein  33.49 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.239256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0993  hypothetical protein  31.5 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641026  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2886  hypothetical protein  27.69 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1304  hypothetical protein  29.65 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.309528  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5343  hypothetical protein  27.04 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0144  hypothetical protein  25.69 
 
 		 391 aa  42  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.668132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>