16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0351 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0351  hypothetical protein  100 
 
 
653 aa  1337    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2376  hypothetical protein  21.83 
 
 
679 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114477  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2371  hypothetical protein  25 
 
 
674 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2377  hypothetical protein  22.99 
 
 
661 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.106447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2622  hypothetical protein  22.04 
 
 
647 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5368  hypothetical protein  23.28 
 
 
666 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100137  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3603  hypothetical protein  20.07 
 
 
640 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154246  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  32.53 
 
 
657 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  22.78 
 
 
326 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  32.53 
 
 
657 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  32.53 
 
 
657 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  32.53 
 
 
657 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  32.53 
 
 
657 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  32.53 
 
 
657 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  32.53 
 
 
657 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  33.73 
 
 
667 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>