73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2890 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2890  acetyltransferase  100 
 
 
51 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.716796  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  93.33 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  76.19 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  73.81 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.160145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  69.77 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  67.44 
 
 
177 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  59.52 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2839  GCN5-related N-acetyltransferase  57.14 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0772074  normal  0.0165254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  59.52 
 
 
178 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05103  acetyltransferase  56.1 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  61.9 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74926  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  51.06 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.167561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.858173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3086  GCN5-related N-acetyltransferase  56.1 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  56.1 
 
 
163 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
185 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
163 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001236  histone acetyltransferase HPA2  51.11 
 
 
166 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.993571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  56.52 
 
 
182 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508439  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  53.66 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  51.22 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  52.38 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  53.66 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000258649  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  56.1 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  56.1 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3814  putative acetyltransferase YhhY  40.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  56.1 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  56.1 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  56.1 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  56.1 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  56.1 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3725  putative acetyltransferase YhhY  45.24 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3916  putative acetyltransferase YhhY  40.48 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.73756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3747  putative acetyltransferase YhhY  40.48 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3736  putative acetyltransferase YhhY  40.48 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3857  putative acetyltransferase YhhY  40.48 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4759  putative acetyltransferase YhhY  45.24 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal  0.225822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03292  predicted acetyltransferase  42.86 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0151809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1454  GCN5-related N-acetyltransferase  54.76 
 
 
193 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03245  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0209792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3884  putative acetyltransferase YhhY  42.86 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0272  putative acetyltransferase YhhY  42.86 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.417468  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3640  putative acetyltransferase YhhY  42.86 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2212  GCN5-related N-acetyltransferase  53.66 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3920  putative acetyltransferase YhhY  42.86 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  50 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.4166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  34.88 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0308502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  47.73 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
194 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2987  ribosomal-protein- alanine GNAT family acetyltransferase  52.38 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  48.65 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  51.28 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0879  GCN5-related N-acetyltransferase  45.24 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4739  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613955  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.263332  hitchhiker  0.00000000268657 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2994  GCN5-related N-acetyltransferase  44.74 
 
 
168 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0846  putative acetyltransferase  41.3 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0811  acetyltransferase  41.46 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000146816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  45.24 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3765  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  45.95 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0390446  decreased coverage  0.000407903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>